Tujuan Kampus FAI Medan adalah berperan sebagai institusi terkemuka dalam sektor pendidikan Islam dan pengajaran umum pada provinsi Sumatera Utara. Agar mencapai hal ini, institusi berusaha mengarahkan sumber daya kepada penguatan kualitas pengajaran, peningkatan infrastruktur, dan penguatan kolaborasi melalui berbagai lembaga Kampus Islam Sumut 2